Giuditta Isoldi si diploma in flauto sotto al guida di Paolo Zampini presso il Conservatorio di Firenze e successivamente viene ammessa al Koninkljik Conservatorium de L’Aia, dove studia flauti storici con Barthold Kuijken, Kate Clark e Wilbert Hazelzet e consegue un diploma di Master di ricerca nel 2015.

Dopo gli studi intraprende una intensa attività concertistica soprattutto nei Paesi Bassi, dove si esibisce regolarmente con ensemble di strumenti storici quali The Bach Orchestra of The Netherlands, Musica Poetica e Lutherse Bach Ensemble in sale e festival quali Festival di Musica Antica di Utrecht, Concertgebouw di Amsterdam, Orgelpark di Amsterdam.

Dal 2017 Giuditta Isoldi è membro stabile del Consort di Traverse rinascimentali “The Attaignant Consort” fondato da Kate Clark.